La santé intestinale et le microbiote

Un microbiote en pleine forme grâce aux probiotiques

Rédigé par Experts COPMED
30/04/2025

Stress, alimentation moderne, pollution… Quand le microbiote est perturbé par certains facteurs, c’est tout l’organisme qui en pâtit : digestion compliquée, baisse d’énergie, immunité fragilisée. Heureusement, cet équilibre peut être restauré grâce aux probiotiques qui se révèlent être des alliés précieux pour notre intestin, qui n’est autre que notre deuxième cerveau.

LE GARDIEN DE L'ÉQUILIBRE INTÉRIEUR

Le microbiote intestinal, aussi appelé la flore intestinale, est un écosystème complexe situé principalement dans notre intestin qui abrite plusieurs milliards de micro-organismes dont des bactéries. Chacun de ces micro-organismes réalise des actions spécifiques et participe au maintien de l’équilibre global de l’organisme. L’équilibre repose sur une diversité suffisante entre les bonnes bactéries qui soutiennent notre santé et celles potentiellement nuisibles.

Le microbiote fascine tant il participe à de nombreuses fonctions de notre organisme :

  • La digestion : il aide à décomposer les aliments complexes que l’organisme ne peut digérer seul, comme les fibres, en les transformant en composés bénéfiques (ex. : acides gras à chaîne courte). Cette action favorise une bonne digestion et contribue à limiter les inconforts tels que les ballonnements ou les troubles du transit.
  • L’immunité : comme 70 % des cellules immunitaires de notre corps se trouvent dans l’intestin, le microbiote agit comme une barrière de protection en empêchant les bactéries pathogènes de se développer et en stimulant les défenses naturelles.
  • L’axe intestin-cerveau : le microbiote influence directement le système nerveux via des échanges constants entre l’intestin et le cerveau. Il impacte ainsi l’humeur, la gestion du stress et le sommeil.
  • La gestion du poids : un microbiote diversifié contribue à équilibrer le métabolisme, réguler le stockage des graisses et favoriser la satiété.
  • La santé vaginale : le microbiote vaginal, dominé par des bactéries du genre Lactobacillus, joue le rôle de bouclier et participe à maintenir un pH équilibré afin de garantir une bonne santé intime.
  • La santé cutanée : en interagissant avec le système immunitaire et en régulant les inflammations, le microbiote cutané contribue à la protection contre les agressions extérieures.

    Cependant, l’équilibre du microbiote est fragile et peut basculer vers une dysbiose, situation dans laquelle un déséquilibre entre les bonnes et les mauvaises bactéries est constaté. Comme le microbiote remplit de nombreuses fonctions au sein de l’organisme, un déséquilibre peut avoir des répercussions non seulement sur la santé digestive mais aussi sur le bien-être général. 

    Les principaux facteurs qui perturbent le microbiote sont :

    • Une alimentation déséquilibrée : les régimes modernes, souvent riches en sucres raffinés, graisses saturées et aliments ultra-transformés, appauvrissent la diversité des bonnes bactéries qui composent le microbiote. De plus, une consommation insuffisante de fibres (présentes dans les fruits, légumes, légumineuses ou céréales complètes) prive les bonnes bactéries de leur nourriture indispensable.
    • Le stress chronique : un stress prolongé peut perturber l’équilibre intestinal. En augmentant la perméabilité de la barrière intestinale, il facilite le passage de substances indésirables, peut provoquer des inflammations et peut engendrer des troubles digestifs.
    • Les médicaments dont les antibiotiques : bien que nécessaires dans certaines situations, les antibiotiques possèdent un impact non négligeable à la fois sur les bactéries pathogènes que sur les bonnes bactéries.
    • L’exposition à la pollution : l’air, l’eau et certains aliments peuvent contenir des substances néfastes comme les pesticides, les métaux lourds ou les particules fines. Ces éléments impactent directement la composition et la diversité du microbiote et entraînent des déséquilibres parfois difficiles à corriger.
    • Un mode de vie sédentaire ou désorganisé : le manque d’activité physique, un sommeil insuffisant ou irrégulier et de mauvaises habitudes alimentaires (comme le grignotage) affaiblissent la santé intestinale. À l’inverse, une routine avec une alimentation équilibrée, de l’exercice et du repos favorise un microbiote plus résilient.

    ✅ À retenir :

    • Un microbiote équilibré joue un rôle crucial dans plusieurs aspects de la santé : confort digestif, immunité, résistance au stress et bien être global.
    • Les probiotiques soutiennent la flore intestinale en renforçant les bonnes bactéries.
    • Chaque souche probiotique a des propriétés spécifiques et doit être choisie en fonction des besoins individuels.
    • Une alimentation riche en fibres, en prébiotiques et en aliments fermentés associée à une bonne hygiène de vie favorise un microbiote sain.

    Lorsque ces facteurs se cumulent, le microbiote perd de sa diversité et de sa stabilité, ce qui peut entraîner des répercussions sur l’ensemble de l’organisme : troubles digestifs, fatigue, baisse de l’immunité et inconforts variés. Heureusement, il est possible d’aider à restaurer l’équilibre en adoptant des habitudes saines et en s’appuyant sur des solutions naturelles comme les probiotiques.

    LES PROBIOTIQUES AU SERVICE DU MICROBIOTE

    Les probiotiques sont des micro-organismes vivants, principalement des bactéries et des levures, naturellement présents dans notre corps et dans certains aliments. Ils contribuent au maintien d’un microbiote sain en renforçant les bonnes bactéries qui peuplent notre intestin et en limitant la prolifération des bactéries nuisibles.

    En premier lieu, les probiotiques agissent directement au sein du microbiote pour restaurer l’équilibre lorsque celui-ci est perturbé. En effet, lorsqu’ils sont correctement sélectionnés et administrés en quantité suffisante, ils contribuent à restaurer les fonctions du microbiote. Ainsi, en favorisant une meilleure digestion, ils réduisent notamment les inconforts digestifs et en renforçant la barrière intestinale, ils participent par exemple au soutien de l’immunité.

    Tout comme la flore intestinale, les probiotiques peuvent aussi agir au-delà des intestins. En effet, ils peuvent également soutenir la flore cutanée et la flore intime. Enfin, en agissant sur l’axe intestin-cerveau, ils aident à réguler l’humeur et à réduire les effets du stress

    Les probiotiques, un intérêt avéré pour la santé du microbiote

    Il existe une grande diversité de souches probiotiques, chacune ayant des propriétés spécifiques et des actions ciblées. Vous avez peut-être déjà entendu parler des Lactobacillus ou des Bifidobacterium, deux souches particulièrement étudiées pour leurs interactions avec le microbiote mais il existe de nombreuses autres souches dont les caractéristiques varient selon les besoins de l’organisme.

    Les probiotiques se trouvent naturellement dans certains aliments fermentés comme les yaourts, le kéfir, la choucroute, les cornichons fermentés ou encore le miso et le kombucha. Ces aliments, souvent consommés dans les traditions culinaires anciennes, apportent une diversité intéressante de micro-organismes bénéfiques. Cependant, ils sont souvent absents de l’alimentation moderne qui privilégie les produits transformés ou pasteurisés dont l’apport naturel en probiotiques est limité.

    Pour répondre à des besoins spécifiques, en cas de dysbiose ou en prévention d’un risque de déséquilibre notamment lors des changements de saison, périodes de stress intense ou suite à un traitement médical, la supplémentation en probiotiques peut s’avérer utile. Ces compléments alimentaires naturels concentrent des souches précises, soigneusement sélectionnées pour leur efficacité.

    QUEL PROBIOTIQUE EST FAIT POUR VOUS ?

    Tous les probiotiques ne sont pas identiques, ainsi, il est important de bien comprendre leurs spécificités avant de faire un choix de cure.

    La diversité des souches est un premier critère de choix puisque chaque souche agit différemment et cible des besoins particuliers. Par exemple, certaines souches sont plus adaptées pour améliorer la digestion tandis que d’autres soutiennent l’immunité ou contribuent à la gestion du stress.

    Le nombre de micro-organismes vivants, exprimé en Unités Formant Colonies (UFC) est également un indicateur à prendre en compte. Une concentration adaptée garantit que les probiotiques atteignent l’intestin en nombre suffisant pour exercer leurs bienfaits.

    Enfin, la galénique, c’est-à-dire la forme sous laquelle le probiotique se trouve, a aussi un impact. Les gélules sont une solution pratique pour une prise facile au quotidien avec un dosage précis et adapté. Si les gélules sont végétales, c’est encore mieux : elles conviennent aux personnes suivant une alimentation végétarienne ou végétalienne, sont bien tolérées par les organismes sensibles et s’inscrivent dans une démarche plus respectueuse de l’environnement.

    Il est également recommandé de choisir une complémentation formulée par un laboratoire français reconnu, garantissant une traçabilité rigoureuse, une qualité optimale des souches et une formulation adaptée aux besoins du microbiote. 

    Trouver le meilleur probiotique peut être un défi

    Chaque microbiote est unique, influencé par l’alimentation, le mode de vie, l’âge ou encore l’état de santé général. C’est pourquoi il n’existe pas un probiotique universel mais plutôt des souches adaptées à des besoins spécifiques. Une personne cherchant à améliorer sa digestion n’aura pas les mêmes exigences qu’une autre souhaitant renforcer son immunité ou mieux gérer les effets du stress.

    PRÉSERVER SON MICROBIOTE AU QUOTIDIEN

    Un microbiote en pleine santé repose sur de bonnes habitudes quotidiennes qui favorisent la diversité et l’équilibre des micro-organismes. Plusieurs gestes permettent de prendre soin de la flore intestinale et de soutenir son bon développement naturellement.

    L’alimentation est la première bonne habitude à adopter. Une alimentation pro-microbiote privilégie les aliments riches en fibres et en prébiotiques qui servent de nourriture aux bonnes bactéries. Parmi eux, on retrouve les asperges, les artichauts, les poireaux, les bananes ou encore les légumineuses. Sans oublier les aliments fermentés, qui sont une source naturelle de probiotiques.

    Parfois, ces apports alimentaires ne suffisent pas à maintenir un microbiote équilibré, notamment en cas de perturbations comme une prise d’antibiotiques, une période de stress intense ou des troubles digestifs récurrents. Dans ces situations, une cure de probiotiques ciblés est à envisager.

    A noter que les compléments alimentaires ne remplacent pas une bonne hygiène de vie mais ils peuvent s’avérer être un soutien pour accompagner et renforcer l’organisme.

    Toutefois, prendre soin de son microbiote ne se limite pas à l’alimentation et aux probiotiques. D’autres facteurs sont à prendre en compte pour préserver l’équilibre intestinal. Un sommeil de qualité contribue à une flore intestinale stable car le microbiote suit lui aussi un rythme biologique qui influence sa diversité. L’hydratation aide également à son bon fonctionnement. La gestion du stress y contribue car un stress chronique peut altérer la composition du microbiote et augmenter la perméabilité intestinale.

    La mise en place d’une routine qui allie alimentation variée, mode de vie équilibré et un soutien ponctuel par des probiotiques peut permettre d’entretenir son microbiote sur le long terme. Plutôt que d’attendre un déséquilibre pour agir, il est préférable d’intégrer ces bonnes pratiques au quotidien, en prévention.

    Notre équipe de rédacteurs est composée de docteurs en médecine, biochimistes, naturopathes et d’experts en nutrition, micronutrition et diététique. 

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